Екатерина Анатольевна Печерская в 1995 году с отличием окончила Пензенский государственный университет по квалификации инженер-метролог-электроник. Во время учебы в аспирантуре удостоена Стипендии Правительства Российской Федерации (1997–1999 гг.). В 1999 — защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата технических наук на тему «Разработка и исследование методов автоматизированных измерений электрических свойств сегнетоэлектриков», в 2010 — диссертацию на соискание ученой степени доктора технических наук по специальности 05.11.01 — Приборы и методы измерения (по видам измерений). Стаж научно-педагогической деятельности — более 10 лет, ученое звание доцент (2007 г.).

В 2016 году с отличием окончила магистратуру по профилю подготовки «Управление в высшем образовании» (Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», Москва).